Ở kỳ chuyển nhượng mùa hè vừa qua, Dortmund đã liên hệ với Toprak để lấp vào chỗ trống mà Mats Hammels để lại. Tuy nhiên, các cuộc đàm phán bất thành và đội bóng vùng Ruhr chuyển hướng chiêu mộ Marc Bartra từ Barca.
Dù trong biên chế Dortmund hiện tại có tới 5 cầu thủ có thể đá trung vệ nhưng trường hợp Subotic chấn thương dài hạn và khó có thể xem là một lựa chọn của Thomas Tuchel. Trong 4 cái tên còn lại, thì Sven Bender vốn là một tiền vệ trung tâm, Matthias Ginter được sử dụng ở cánh phải. Vì thế, trong tay HLV Tuchel chỉ có Sokratis và Marc Bartra là 2 trung vệ thực thụ.
Chính bởi lý do đó, BLĐ đội bóng quyết định quay trở lại thương vụ hỏi mua trung vệ Toprak của Leverkusen. Thay vì mất nhiều thời gian đàm phán, Dortmund đã kích hoạt điều khoản phá vỡ hợp đồng của ngôi sao người Thổ Nhĩ Kỳ.
Cầu thủ 27 tuổi sẽ ký bản hợp đồng có thời hạn 4 năm với đội chủ sân Signa Iduna Park. Tuy nhiên, Toprak sẽ chỉ chuyển tới Dortmund khi mùa giải 2016/17 kết thúc.