Trưởng thành từ lò đào tạo của Torino nhưng tên tuổi của Balzaretti bắt đầu được biết đến trong làng bóng đá Italia từ… Juventus. Hậu vệ sinh năm 1981 này chính là một trong những lứa cầu thủ trẻ của Juve gắn bó với CLB trong giai đoạn phải chơi ở Serie B sau án phạt Calciopoli (2006). Khi Juve trở lại Serie A, Balzaretti bị đẩy sang Fiorentina nhưng không gặt hái được thành công, sau đó tới Palermo và trở thành một trong những hậu vệ biên xuất sắc nhất Serie A.

Phong độ đỉnh cao trong màu áo Palermo đã giúp Balzaretti có được suất tham dự EURO 2012 cùng ĐT Italia dưới thời HLV Cesare Prandelli, và đấy cũng là giải dấu duy nhất của Balzaretti với Azzurri. Chơi nổi bật trong hai cuộc đấu đầy khó khăn gặp Anh tại tứ kết cũng như Đức tại bán kết, Balzaretti được Roma mang về với giá chuyển nhượng 4,5 triệu euro cùng rất nhiều hy vọng. Thế nhưng không ai nghĩ đội bóng thủ đô là treo giày của hậu vệ trái này.

2 năm liên tiếp vật lộn với chấn thương xương chậu đã đánh gục Balzaretti. Trận đấu gặp Palermo ở vòng cuối mùa giải năm ngoái đã chứng kiến Balzaretti thi đấu trọn vẹn 90 phút cho Roma nhưng chấn thương tái phát trong mùa Hè này đã khiến cầu thủ này đi tới quyết định giải nghệ. Balzaretti đã thi đấu tổng cộng 44 trận cho Roma, ghi được 1 bàn thắng, đáng chú ý đó là pha lập công rất đáng nhớ vào lưới Lazio trong trận derby thủ đô vào mùa 2013/14.

Sau khi giải nghệ, Balzaretti sẽ được giữ một vai trò trong hệ thống điều hành Roma dưới quyền GĐKT Walter Sabatini.