Mùa giải 2016 vẫn chưa kết thúc hoàn toàn. Ngày 24/9 sẽ diễn ra trận chung kết lượt đi Cúp Quốc gia giữa Than.QN và HN.T&T trên sân Cẩm Phả. Ngày 29/9, trận chung kết lượt về giữa hai đội bóng này sẽ diễn ra trên sân Hàng Đẫy.

Tuy nhiên, điều đáng nói là trong thành phần hai đội bóng này có khá nhiều tuyển thủ quốc gia mà lẽ ra sẽ phải hội quân tại TP.HCM vào ngày 24/9. Bên phía Hà Nội T&T có: Ngọc Đức, Thành Lương, Văn Quyết. Than.QN còn có quân đông hơn khi Minh Tùng, Tuấn Linh, Minh Tuấn, Xuân Tú cũng góp mặt ở danh sách ĐTQG.

Nếu các cầu thủ này phải lên tập trung ở ĐTQG thì đương nhiên sức mạnh của đội bóng sẽ bị ảnh hưởng. Chất lượng của hai trận chung kết Cúp QG cũng không được đảm bảo. Vì thế, VFF chấp nhận đồng ý cho các tuyển thủ này được hoàn thành trách nhiệm với CLB và sau đó sẽ hội quân cùng ĐTQG.