Trước khi bừng sáng ở Serie A, Pjanic đã được trui rèn trong môi trường Ligue 1. Tiền vệ người Bosnia trưởng thành từ lò đào tạo Metz và ghi dấu ấn mạnh mẽ trong màu áo Lyon (2008-2011). Trong 3 mùa giải tại Gerland, Pjanic ghi tổng cộng 16 bàn thắng sau 120 trận.
Ngay mùa giải thứ hai khoác áo Lyon, chàng trai khi đó 20 tuổi đã được tiếp quản chiếc áo số 8 của tượng đài Juninho. Ở Pjanic có những phẩm chất tương đồng với ngôi sao người Brazil: kỹ thuật khéo léo, nhãn quan sắc sảo và óc kiến tạo tài tình. Chính Juninho đã dạy Pjanic đá phạt để trở thành một chuyên gia hàng đầu châu Âu như bây giờ.
Có tới 5/8 bàn thắng của Pjanic tại sân chơi Champions League được thực hiện trong thời gian khoác áo Lyon. Ở tuổi đôi mươi, cầu thủ người Bosnia đã từng tung hoành ở giải đấu danh giá nhất châu Âu. Chưa ai quên cú sút nhanh như điện xẹt của Pjanic vào lưới Real Madrid tại trận lượt về vòng 1/8 Champions League 2009/10. Một bàn thắng quý hơn vàng khi nó giúp Lyon vượt qua gã khồng lồ Tây Ban Nha và sau đó lọt vào tới tận bán kết.
“Lyon vẫn ở trong tim tôi”, Pjanic chia sẻ trước chuyến hành quân lên đất Pháp của Juventus. Quãng thời gian tuyệt đẹp ở Lyon đã giúp Pjanic trưởng thành mọi mặt để tiếp tục tỏa sáng trong màu áo Roma và Juventus hiện tại. Những kỷ niệm sẽ ùa về khi Pjanic tái ngộ Lyon, song chiến thắng cho Juve mới là điều mà cầu thủ người Bosnia quan tâm nhất.