Ngày 9/5, AFC đã tiến hành bốc thăm vòng loại U16 và U19 châu Á 2020. Ở giải lần này, có tổng cộng 47 đội tham dự, được chia thành 2 khu vực Tây Á (25 đội) và Đông Á (22 đội). 47 đội được chia thành 11 bảng.
11 đội đứng nhất cùng với 5 đội đứng thứ nhì có thành tích tốt nhất (chưa xác định được chủ nhà của VCK) sẽ giành quyền vào chơi VCK. Theo kết quả bốc thăm, U16 Việt Nam nằm ở bảng H cùng với Australia, Timor Leste, Macau và Mông Cổ.
Có thể thấy, đối thủ lớn nhất của U16 Việt Nam là U16 Australia. Đây là đối thủ đầy duyên nợ của các cầu thủ trẻ Việt Nam ở lứa tuổi này khi gặp nhau 3 lần liên tiếp trong 2 kỳ U16 châu Á vừa qua. Cụ thể ở vòng loại U16 châu Á 2016, U16 Việt Nam thua 0-1 nhưng thắng lại 3-2 ở VCK.
Tại vòng loại U16 châu Á 2018, U16 Việt Nam thua U16 Australia 1-3. Thuận lợi cho U16 Việt Nam ở vòng loại U16 châu Á 2020 là là được chơi trên sân nhà khi được quyền đăng cai vòng loại bảng H. Vòng loại U16 châu Á 2020 sẽ diễn ra từ 14-22/9 tới.