Với mô hình "Chuẩn Nhật Bản", CLB Phù Đổng được xây dựng theo mô hình bóng đá cộng đồng, tức là đội bóng không có một ông chủ lớn thực sự nào như tuyệt đại đa số các đội chuyên nghiệp ở Việt Nam. Với mô hình này, đội bóng được nuôi dưỡng bởi nguồn ủng hộ của các nhà tài trợ, nhà bảo trợ.
Trong lễ ra mắt nhà bảo trợ Mitshubishi Motors Việt Nam hôm qua, các nhà tài trợ cũng ủng hộ hơn 1 tỷ đồng. Mục tiêu lớn nhất của đội Phù Đổng là lên V.League và cạnh tranh một cách sòng phẳng với người anh lớn Hà Nội FC, cả trên mặt sân lẫn trên các khán đài.
Cũng trong buổi lễ ra mắt nhà bảo trợ, Phó Chủ tịch Triệu Quang Hà cũng công bố thành viên mới của CLB Phù Đổng, đó là Vũ Như Thành - cựu đội trưởng ĐT Việt Nam, nhà vô địch Đông Nam Á 2008, nhà vô địch V.League. Ngoài Vũ Như Thành, nhiều khả năng Cao Sỹ Cường - một tuyển thủ quốc gia khác - cũng sẽ đầu quân cho Phù Đổng. HLV trưởng của đội Phù Đổng là Lê Đức Tuấn - cầu thủ của đội năm ngoái. HLV Triệu Quang Hà được bổ nhiệm là Phó Chủ tịch CLB.