Để góp mặt ở vòng đấu bảng AFC Champions League, HN.T&T phải trải qua 2 trận đấu sơ loại. Đầu tiên là chuyến làm khách trên sân Kitchee của Hong Kong vào ngày 31/1/2017. Nếu giành chiến thắng, thầy trò ông Chu Đình Nghiêm sẽ tiếp tục thực hiện cuộc “viễn chinh” ở Hàn Quốc gặp Jeju United FC. Đội bóng này vừa kết thúc K-League với vị trí thứ ba mùa giải 2016.

Rõ ràng, HN.T&T có cơ hội để đánh bại Kitchee bởi đây là đối thủ ngang tầm nếu không muốn nói là dưới cơ so với đại diện của V-League. Tuy nhiên, cũng không thể xem thường đối thủ bởi những đại biểu của Hàn Quốc từng gây nhiều khó khăn cho đội bóng thủ đô Hà Nội. Ở trận sơ loại thứ 2 của mùa bóng 2016, HN.TT&T cũng đã thua Pohang Steelers với tỷ số 0-3 ngay tại sân đối phương.

Phải đối mặt với đối thủ khó chơi, thầy trò ông Chu Đình Nghiêm còn phải vượt qua một rào cản tâm lý khác là các trận sơ loại AFC Champions League diễn ra đúng dịp Tết nguyên đán. Theo đó, chuyến làm khách trên sân Kichee diễn ra ngày 31/1/2017, tức 4 tháng Giêng năm Đinh Dậu. Điều này cũng đồng nghĩa, HN.T&T phải lên đường muộn nhất vào ngày mùng 2 Tết theo lệ thông thường.

Nếu vượt qua vòng sơ loại, HN.T&T sẽ nằm ở bảng E cùng với Kashima Antlers (Nhật Bản), Muangthong Utd (Thái Lan) và đội thắng trong trận play-off khác của khu vực Đông Á. Vòng bảng AFC Champions League 2017 sẽ bắt đầu từ 28/2/2017.

Trong trường hợp không được dự AFC Champions League do thua ở vòng sơ loại, HN.T&T sẽ xuống chơi ở AFC Cup chứ không phải bị loại hẳn như những năm trước. Theo kết quả bốc thăm, đội bóng thủ đô sẽ nằm cùng bảng Felda Utd (Malaysia), Tampines Rovers (Singapore) và Ceres (Philippines).

Cũng cần nói thêm rằng, nếu HN.T&T góp mặt ở vòng đấu bảng AFC Champions League, SHB Đà Nẵng sẽ được quyền chơi AFC Cup thay đội bóng Thủ đô ở bảng này. Dù đứng thứ ba V-League 2016 nhưng SHB Đà Nẵng được chọn là do đội đứng nhì V-League 2016 Hải Phòng không đáp ứng đủ tiêu chuẩn của AFC.
 
Với tư cách ĐKVĐ cúp QG, Than.QN nghiễm nhiên đi thẳng vào vòng bảng AFC Cup. Theo kết quả bốc thăm, thầy trò ông Phan Thanh Hùng sẽ nằm ở bảng H khá nhẹ nhàng cùng các đối thủ không thật sự đáng gờm là Yadanarbon (Myanmar), Lanexang Utd (Lào) và đội thắng trong cặp đấu giữa Pnom Penh Crown (Campuchia)/Home Utd (Singapore).