Thomas Mueller và cô nàng Lisa vẫn chưa có con. Nhưng tiền vệ ĐT Đức đóng vai trò người cha tình thần đối với không ít trẻ em mồ côi, bởi anh là vị đại sứ tích cực nhất của YoungWings, tổ chức phi lợi nhuận chuyên giúp đỡ trẻ em bất hạnh mất cha, mẹ hoặc mồ côi cả cha lẫn mẹ có hoàn cảnh khó khăn. Mục tiêu của YoungWings là động viên tinh thần và quan trọng hơn là tạo điều kiện cho những trẻ mồ côi được phát triển bình thường như những trẻ em khác được gia đình bao bọc.

Muller bắt đầu nhận lời làm đại sứ cho YoungWings từ năm 2011. Kể từ thời điểm đó, ngôi sao Bayern liên tục có những đóng góp về vật chất cũng như tích cực tuyên truyền, kêu gọi đồng đội và người hâm mộ quan tâm, ủng hộ cho YoungWings. 

Trước khi sang Brazil tham dự VCK World Cup, Mueller cũng đã dành thời gian giao lưu với những trẻ em mồ côi của YoungWings. Lisa - một bé gái mất cha từ năm 6 tuổi ở Munich xúc động tâm sự: “Chú Thomas thường xuyên tới thăm, tặng quà và động viên cháu và các bạn khác. Chú ấy giống như một người cha thứ hai của cháu”.

Về phần mình, tiền vệ ĐT Đức thổ lộ: “Có tới hàng triệu trẻ em mồ côi ở nước Đức, phần lớn trong số chúng gặp vấn đề về tâm lý. Trẻ em cần được giúp đỡ và đó là lý do tôi nhân lời tham gia chung tay với YoungWings. Vợ tôi, Lisa ủng hộ tôi và cô ấy cũng là một thành viên tích cực của tổ chức này”.