Trong 6 quyết định kỷ luật, CLB Hà Nội nhận đến 4 án phạt. Theo đó, án phạt nặng nhất dành cho cầu thủ Nguyễn Xuân Tú khi bị cấm thi đấu 5 trận kế tiếp và phạt 10 triệu đồng vì có hành vi xâm phạm thân thể và đe dọa trong trận đấu giữa Huế - Hà Nội trên sân Tự Do chiều 22/3.
Ngoài Xuân Tú, 2 cầu thủ khác của Hà Nội là thủ môn Anh Đức và ngoại binh Aniekan cũng bị cấm thi đấu 2 trận và phạt 5 triệu đồng mỗi người. Đồng thời đội Hà Nội còn bị phạt 2 triệu đồng vì có 5 cầu thủ bị thẻ vàng trong trận đấu Huế - Hà Nội ở vòng 2.
Ngoài 4 án phạt dành cho CLB Hà Nội, 2 án kỷ luật còn lại thuộc về CLB Tây Ninh, trong đó có một quyết định phạt 3 triệu đồng do vi phạm về nghi thức thủ tục tiến hành trận đấu giữa F.Tây Ninh – Đắk Lắk vào chiều 22/3 vừa qua.